Jak všichni víme, celé stěhování by nemělo přesáhnout čtyři měsíce. Přesunovat se bude přibližně 25.500 bm (bm = běžný metr) knih, vázaných časopisů a spisů, z toho asi 11.300 bm z depozitního skladu Lhota.

Nejdříve se vystěhuje Klementinum. První na řadě je sklad II (očipované knihy dle signatur A, B, F a nečipované řady M, N, D, E, K, G, H). V těsném závěsu následují sklad I (časopisy do r. 1984) a sklad III (časopisy od r. 1985). Poté se vystěhuje depozitní sklad ve Lhotě.

Knihovní fond se bude přesunovat speciálními nákladními automobily určenými ke stěhování knih. Na nakládání a vykládání bude dohlížet pracovník STK. Stěhování proběhne pouze v příznivých klimatických podmínkách - teplota a vlhkost vzduchu v budově Klementina/depozitáře a mimo tyto budovy musí být přibližně stejná. Přeprava bude co nejrychlejší, aby se minimalizovala doba, po kterou budou knihy mimo stabilní prostředí. Jakákoli manipulace s knihami z historického fondu je přípustná pouze pod dohledem zaměstnanců STK. Ti budou přítomni i u vybírání knih z trezorové místnosti, jejich převozu a znovuuložení v NTK.  

Co se týče starých historických map, bude se převážet cca 110 ks. Jsou velkého formátu (většinou 1,16 x 0,80 m). První část, asi 80 ks, je po jednotlivých listech nebo paspartách uložena v mapovnicích. Tyto mapy se budou se stěhovat zabalené po malých vrstvách do kartonu a následně do bublinkové fólie. Další mapy se vloží  do obalu z tvrdých kartonových desek o rozdílných rozměrech a takto mohou být stěhovány bez dalších úprav. Nástěnné mapy (2 kusy) o rozměrech 244 x 284 cm se přesunou svinuté, pravděpodobně ve speciálně vyrobeném tubusu. Jakákoli manipulace s mapami je přípustná opět pouze v přítomnosti zaměstnanců STK.

Kromě celého fondu se stěhuje i nábytek a další kancelářské a jiné vybavení (od trezorů, kartoték a výpočetní a reprografické techniky po ledničky, psací stroje, lampy, větráky, varné konvice, obrazy a květiny...). Jako první se bude stěhovat PR a odbor služeb a jako poslední se přesunou servery a školicí středisko. Podrobný harmonogram stěhování se upřesní vždy s týdenním předstihem.